1、地点不同：上证指的是上海证券交易所，而深证指的是深圳证券交易所；2、制度不同：二者基本规则是一样的，其差别在于收市最后3分钟，上证的交易规则是连续竞价，而深市的交易规则是集合竞价；3、代码不同：上证主板股票代码是60开头，而深证主板股票代码是000开头；4、板块不同：上证只有主板与B股；而深证有主板、中小板、创业板和B股。

上海证券交易所成立于1990年11月26日，同年12月19日开业，受中国证监会监督和管理，是为证券集中交易提供场所和设施、组织和监督证券交易、实行自律管理的会员制法人。

上海证券交易所已发展成为拥有股票、债券、基金、衍生品四大类证券交易品种的综合型证券交易所，建立了保障上海证券市场规范有序运作的自律监管体系。

深圳证券交易所成立于1990年12月1日，是经国务院批准设立的全国性证券交易场所，是为证券集中交易提供场所和设施，组织和监督证券交易，实行自律管理的法人，由中国证券监督管理委员会监督管理。深交所履行市场组织、市场监管和市场服务等职责。